Α. Οι νομοθετικές διατάξεις που διέπουν το πλαίσιο λειτουργίας του ΚΕΤΕΚΝΥ είναι οι κατωτέρω:

• Ν. 4286/2014 (ΦΕΚ Α’ 194/19.9.2014): Με τον εν λόγω νόμο και ειδικότερα υπό τον τίτλο «Γενικές διατάξεις για τη δημιουργία συστήματος αμοιβών νοσοκομείων-σύσταση και καταστατικό της εταιρείας με την επωνυμία «Εταιρεία συστήματος αμοιβών νοσοκομείων ανώνυμη εταιρεία» ιδρύεται ο Οργανισμός και καταρτίζεται το καταστατικό του.
• Ν. 4461/2017,άρθρο 48 (ΦΕΚ A’ 38/28.03.2017): Το άρθρο έβδομο του ν. 4286/2014 αντικαθίσταται ως εξής: Το μετοχικό κεφάλαιο της Εταιρείας καλύπτεται ολόκληρο από το Ελληνικό Δημόσιο, το οποίο για την άσκηση των μετοχικών του δικαιωμάτων εκπροσωπείται από τον Υπουργό Υγείας.
• Ν. 4486/2017, άρθρο 66 (ΦΕΚ A’ 115/7.8.2017): Με το άρθρο 66, αποτυπώνεται η «Αναδιάρθρωση και Μετονομασία της «Εταιρεία Συστήματος Αμοιβών Νοσοκομείων Ανώνυμη Εταιρεία» (Ε.Σ.Α.Ν. Α.Ε.)». Πλέον, ο οργανισμός μετονομάζεται σε Κέντρο Τεκμηρίωσης και Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών Ανώνυμη Εταιρεία» και διακριτικό τίτλο «ΚΕ.ΤΕ.Κ.Ν.Υ. Α.Ε.».
• Ν. 4722/2020, άρθρα 48 – 52 (ΦΕΚ A’ 177/15.09.2020): Με το άρθρο 48 αντικαθίσταται η παρ. 3 του άρθρου 1 του ν. 4286/2014 (Α΄ 194) και σύμφωνα με το οποίο το Συ.Κ.Ν.Υ. τίθεται σε πλήρη εφαρμογή την 1^η Ιανουαρίου 2021 σε νοσοκομεία που ορίζει ΚΥΑ μετά από εισήγηση του ΚΕΤΕΚΝΥ. Με το άρθρο 49 τροποποιείται η παρ.  6 του άρθρου 1 του ν. 4286/2014 με το ΚΕΤΕΚΝΥ να εισηγείται στον Υπουργό Υγείας την έκδοση και άλλων ιατρικών κωδικοποιήσεων, να διαχειρίζεται και να αναθεωρεί όλες τις ιατρικές κωδικοποιήσεις που χρησιμοποιούνται στο σύστημα υγείας της Χώρας και προς την κατεύθυνση αυτή, με το άρθρο 50, τροποποιείται ο σκοπός του ΚΕΤΕΚΝΥ. Με το άρθρο 51 προστίθενται νέες αρμοδιότητες στο ΚΕΤΕΚΝΥ, όπως η δημιουργία ηλεκτρονικής εφαρμογής συλλογής και επεξεργασίας όλων των οικονομικών και ιατρικών στοιχείων και των στοιχείων από τον διοικητικό και ιατρικό φάκελο των ασθενών. Τέλος, με το άρθρο 52 καθορίζονται τα κίνητρα  και η ανταμοιβή των νοσοκομείων για την ορθή και πλήρη καταχώρηση των απαιτούμενων δεδομένων.
• Ν.4771/2021: (ΦΕΚ Α’ 16/1.2.2021): Τροποποίηση του άρθρου 3 του καταστατικού της Ανώνυμης Εταιρείας μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα, με την επωνυμία «ΚΕΝΤΡΟ ΤΕΚΜΗΡΙΩΣΗΣ ΚΑΙ ΚΟΣΤΟΛΟΓΗΣΗΣ ΝΟΣΟΚΟΜΕΙΑΚΩΝ ΥΠΗΡΕΣΙΩΝ ΑΝΩΝΥΜΗ ΕΤΑΙΡΕΙΑ» που κυρώθηκε με το άρθρο δέκατο του ν. 4286/2014, (ηλεκτρονική εφαρμογή καταχώρησης δεδομένων σε συμμόρφωση με το Γενικό Κανονισμό Προστασίας Δεδομένων)
• 4958/2022: (ΦΕΚ Α’ 142/21.7.2022): άρθρο 32 Τροποποίηση του σκοπού της ανώνυμης εταιρείας μη κερδοσκοπικού χαρακτήρα με την επωνυμία «Κέντρο Τεκμηρίωσης και Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών Ανώνυμη Εταιρεία»- Προσθήκη παρ. 1Β στο άρθρο 3 του Καταστατικού (άρθρο δέκατο ν. 4286/2014)
• Ν. 5034/2023: (ΦΕΚ Α’ 69/18.3.2023): άρθρο 127 Ρύθμιση για το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών- Τροποποίηση παρ.3 άρθρου πρώτου ν. 4286/2014
• Ν. 5195/2025: (ΦΕΚ A’ 73/09.05.2025) άρθρο 5 Εξορθολογισμός κοστολόγησης υγειονομικών υπηρεσιών και πράξεων των στρατιωτικών νοσοκομείων και του Νοσηλευτικού Ιδρύματος Μετοχικού Ταμείου Στρατού στο πρότυπο του Εθνικού Συστήματος Υγείας- Τροποποίηση παρ. 3 του άρθρου πρώτου ν. 4286/2014.

• Επιπροσθέτως η λειτουργία του ΚΕΤΕΚΝΥ διέπεται από τις διατάξεις του ν. 4548/2018 περί ανωνύμων εταιρειών και τον 4972/2022 περί ανωνύμων εταιρειών του δημοσίου.

Β. Το κανονιστικό πλαίσιο το οποίο ρυθμίζει τη λειτουργία του ΚΕΤΕΚΝΥ και αποσκοπεί στην εκπλήρωση των σκοπών του ορίζεται με τις κατωτέρω υπουργικές και κοινές υπουργικές αποφάσεις:

• ΥΑ ΦΕΚ Β’ 3699/19.10.2017: Ορίζεται η διαδικασία και ο τρόπος αποστολής στοιχείων διοικητικού και ιατρικού φακέλου ασθενών από τα δημόσια νοσοκομεία και τις ιδιωτικές κλινικές στο ΚΕΤΕΚΝΥ.
• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 1273/2018: Καθορίζεται η αμοιβή του ΚΕΤΕΚΝΥ για τις παρεχόμενες υπηρεσίες του.
• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 1423/26.04.2018: Καθορίζονται τα νοσοκομεία του ΕΣΥ στα οποία τίθεται σε δοκιμαστική εφαρμογή το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.).
• ΥΑ ΦΕΚ B’ 791/27.02.2021: Τροποποιούνται σημεία της ΥΑ «Διαδικασία και τρόπος αποστολής στοιχείων διοικητικού και ιατρικού φακέλου ασθενών από τα δημόσια νοσοκομεία και τις ιδιωτικές κλινικές στην Ανώνυμη Εταιρεία Κέντρο Τεκμηρίωσης και Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (ΚΕ.ΤΕ.Κ.Ν.Υ. Α.Ε.)» (Β’ 3699).
• ΥΑ B’ 782/27.02.2021: Ορίζεται νέος Συστηματικός Κατάλογος Κωδικών της Διεθνούς Στατιστικής Ταξινόμησης Νόσων και Συναφών Προβλημάτων Υγείας με την ονομασία «Ελληνική Τροποποίηση ICD-10, ICD-10-GrM (Greek Modification), έκδοση 2017, εκδοχή (version) 2»
• ΥΑ ΦΕΚ B’ 814/02.03.2021: Ορίζεται νέος Συστηματικός Κατάλογος Κωδικών Ιατρικών Πράξεων με την ονομασία «Ελληνική Ταξινόμηση Ιατρικών Πράξεων (ΕΤΙΠ), έκδοση 2017, εκδοχή (version) 2».
• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 1435/09.04.2021: Ορίζεται το νοσοκομείο όπου τίθεται σε πλήρη εφαρμογή το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.), η διαδικασία υποβολής και αποζημίωσης αυτού.
• ΚΥΑ B’ 2241/31.05.2021: Περιγράφεται η λειτουργία ηλεκτρονικής εφαρμογής για τους σκοπούς του Συστήματος Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.).
• ΥΑ ΦΕΚ Β’ 5720/10.12.2021: Η απόφαση έχει ως θέμα την «Τροποποίηση της υπό στοιχεία Γ2δ/10748/27.2.2021 (Β’782) υπουργικής απόφασης «Έκδοση Καταλόγου Κωδικών της Διεθνούς Στατιστικής Ταξινόμησης Νόσων και Συναφών Προβλημάτων Υγείας (ICD- International Classification of Diseases)» και αφορά στην ένταξη επιπρόσθετων κωδικών σχετιζόμενων με τη νόσο COVID-19.
• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 6226/24.12.2021: Η απόφαση έχει ως θέμα την «Τροποποίηση της υπό στοιχεία Γ2δ/21693/9.4.2021 κοινής υπουργικής απόφασης των Υπουργών Οικονομικών, Εργασίας και Κοινωνικών Υποθέσεων και Υγείας «Ορισμός νοσοκομείου όπου τίθεται σε πλήρη εφαρμογή το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.)». Με τη δημοσίευση της εν λόγω απόφασης, το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.) τίθεται σε πλήρη εφαρμογή σε όλα τα νοσοκομεία της 7ης Υγειονομικής Περιφέρειας.

• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 6027/29.11.2022: Η απόφαση έχει ως θέμα την «Τροποποίηση της υπό στοιχεία Γ2δ/21693/9.4.2021 κοινής υπουργικής απόφασης των Υπουργών Οικονομικών, Εργασίας και Κοινωνικών Υποθέσεων και Υγείας «Ορισμός νοσοκομείου όπου τίθεται σε πλήρη εφαρμογή το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.)». Με τη δημοσίευση της εν λόγω απόφασης, το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.) τίθεται σε πλήρη εφαρμογή σε όλα τα νοσοκομεία της 3^ης Υγειονομικής Περιφέρειας, εκτός του ΓΝ Παπαγεωργίου, στο Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο Θεσσαλονίκης – Π.Γ.Ν.Θ. «ΑΧΕΠΑ», στο Γενικό Νοσοκομείο Σύρου «Βαρδάκειο και Πρώιο», στο Γενικό Νοσοκομείο Λάρισας «Κουτλιμπάνειο και Τριανταφύλλειο», στο Πανεπιστημιακό Γενικό Νοσοκομείο Λάρισας, στο Νοσοκομείο Αφροδίσιων και Δερματικών Νόσων Αθήνας «Ανδρέας Συγγρός» και στο Γενικό Νοσοκομείο Βόλου «Αχχιλοπούλειο», στο Γενικό Νοσοκομείο Αθηνών «Κοργιαλένειο-Μπενάκειο» Ε.Ε.Σ. και στο Γενικό Νοσοκομείο Ελευσίνας «Θριάσιο».

• ΥΑ ΦΕΚ Β’ 2838/27.4.2023: Η απόφαση έχει ως θέμα την τροποποίηση της υπ΄αρ. 77213/2017 υπουργικής απόφασης με τον ορισμό των «Γενικών και Ειδικών Κατευθυντηρίων Οδηγιών Κωδικοποίησης Νοσημάτων και Ιατρικών Πράξεων».

• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 7261/21.12.2023: Η απόφαση έχει ως θέμα την τροποποίηση της υπό στοιχεία Γ2δ/21693/9.4.2021 κοινής υπουργικής απόφασης των Υπουργών Οικονομικών, Εργασίας και Κοινωνικών Υποθέσεων και Υγείας «Ορισμός νοσοκομείου όπου τίθεται σε πλήρη εφαρμογή το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.)». Με τη δημοσίευση της εν λόγω απόφασης, το Σύστημα Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών (Συ.Κ.Ν.Υ.) τίθεται σε πλήρη εφαρμογή σε όλα τα νοσοκομεία του Εθνικού Συστήματος Υγείας.

• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 7262/21.12.2023: Η απόφαση έχει ως θέμα την ρύθμιση θεμάτων σχετικά με τη λειτουργία του Συστήματος Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών. Σε αυτήν την απόφαση ορίζονται τα νοσήλια αναφοράς της 3^ης και 7^ης ΥΠΕ.

• ΥΑ ΦΕΚ Β’248/17.1.2024: Η απόφαση έχει ως θέμα «έκδοση Καταλόγου Σπανίων Νοσημάτων»

• ΥΑ ΦΕΚ Β’1068/15.2.2024: Η απόφαση έχει ως θέμα «Αποστολή αρχείων κόστους νοσηλείας ασθενών από τα δημόσια νοσοκομεία στο Κέντρο Τεκμηρίωσης και Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών»

• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 5477/03.10.2024: Η κοινή υπουργική απόφαση έχει ως θέμα την Τροποποίηση της υπό στοιχεία Γ2δ/68058/21.12.2023 κοινής απόφασης των Υπουργών Εθνικής Οικονομίας και Οικονομικών και Υγείας με θέμα «Ρύθμιση θεμάτων σχετικά με τη λειτουργία του Συστήματος Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών. Σε αυτήν την απόφαση ορίζονται τα νοσήλια αναφοράς των υπόλοιπων ΥΠΕ.

• ΥΑ ΦΕΚ Β’5643/10.10.2024 Η απόφαση έχει ως θέμα «Έκδοση Ελληνικής Ταξινόμησης Ογκολογικών Νοσημάτων»

• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 2114/02.05.2025: Η κοινή υπουργική απόφαση έχει ως θέμα την Τροποποίηση της υπό στοιχεία Γ2δ/68058/21.12.2023 κοινής απόφασης των Υπουργών Εθνικής Οικονομίας και Οικονομικών και Υγείας με θέμα «Ρύθμιση θεμάτων σχετικά με τη λειτουργία του Συστήματος Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών. Σε αυτήν την απόφαση ορίζονται τα νοσήλια αναφοράς του Νοσοκομείου Θεσσαλονίκης Παπαγεωργίου και του Ωνάσειου Καρδιοχειρουργικού Κέντρου.

• ΚΥΑ ΦΕΚ Β’ 3563/08.07.2025: Η κοινή υπουργική απόφαση έχει ως θέμα την Τροποποίηση της υπό στοιχεία Γ2δ/68058/21.12.2023 κοινής απόφασης των Υπουργών Εθνικής Οικονομίας και Οικονομικών και Υγείας με θέμα «Ρύθμιση θεμάτων σχετικά με τη λειτουργία του Συστήματος Κοστολόγησης Νοσοκομειακών Υπηρεσιών. Σε αυτήν την απόφαση ορίζονται τα νέα νοσήλια αναφοράς.